Sobre o Projeto
Por Tiago Guerra
Status do Projeto e Novidades: Informações adicionais sobre este projeto é disponibilizado pelos cientistas do projeto no site oficial do projeto. Para o último relatório de estado, por favor, acesse o relatório de status do projeto (PDF). Para comentar ou fazer perguntas sobre esse projeto, envie um post no fórum oficial do FightAIDS.
O que é a AIDS?
UNAIDS, Programa Conjunto das Nações Unidas sobre HIV / AIDS, estimou que em 2004 existiam mais de 40 milhões de pessoas em todo o mundo vivendo com o HIV, o Vírus da Imunodeficiência Humana. O vírus tem afetado as vidas de homens, mulheres e crianças em todo o mundo. Atualmente, não existe cura no horizonte, só o tratamento com uma variedade de drogas.
O Laboratório do Prof Arthur J. Olson do The Scripps Research Institute (TSRI) está estudando maneiras computacionais para a concepção de novos medicamentos anti-HIV baseado na estrutura molecular. Tem sido demonstrada repetida vezes que a função de uma molécula (uma substância composta por muitos átomos) está relacionado com a sua forma tridimensional. Olson é alvo da protease do HIV ( "pró-tee-ás"), a chave do mecanismo molecular do vírus para bloquear a maturidade do vírus. Estes bloqueadores, conhecido como "inibidores da protease", são, assim, uma forma de evitar o aparecimento dos sintomas da AIDS e prolongar vida. O Laboratório Olson está usando métodos computacionais para identificar novos medicamentos candidatos compatíveis com as características químicas necessárias para bloquear a protease do HIV. Esta abordagem geral é chamada de "Design da Base estrutural da droga", e de acordo com o National Institutes of Health's National Institute of General Medical Sciences, já teve um efeito dramático sobre a vida das pessoas vivendo com a AIDS.
Ainda mais desafiadora, o HIV é um "vírus mutante", então ele está em constante evolução, com novas variantes, algumas das quais são resistentes até mesmo aos atuais medicamentos. Por isso, é vital que os cientistas continuam a sua busca de novos e melhores medicamentos para combater este alvo móvel.
Os cientistas são capazes de determinar as formas experimentais de uma proteína e de uma droga em separadamente, mas nem sempre para ambas. Se cientistas soubessem como uma droga molécula interagisse dentro de sua proteína-alvo, os químicos poderão conceber ainda uma melhor droga, mais potente, do que os medicamentos atuais.
Para enfrentar estes desafios, o projeto FightAIDS@Home do World Community Grid's utiliza um software chamado AutoDock, desenvolvido no laboratório do Prof Olson. AutoDock é uma suíte de ferramentas que prediz como pequenas moléculas, tais como as drogas candidatas, poderão vincular ou "atracar" em um receptor conhecido da estrutura em 3D. A primeira versão do AutoDock foi escrito no Laboratório Olson, em 1990, pelo Dr. David S. Goodsell, desde então, as versões mais recentes, desenvolvida pelo Dr. Garrett M. Morris, foram liberadas, com o acréscimo de novos conhecimentos científicos e as estratégias para AutoDock, computacionalmente tornando mais robusto, mais rápidos e mais fácil de utilizar por outros cientistas. Desde o início deste projeto, o World Community Grid tem sido executando uma versão pré-lançamento do AutoDock4. Em agosto de 2007, World Community Grid começou a executar a nova versão disponível do AutoDock que tornou mais rápido e preciso, podendo manipular as flexíveis moléculas alvo e, portanto, também podendo ser utilizado para a análise de junções protéicas. O AutoDock é usado no projeto FightAIDS@Home para combinar um grande número de pequenas moléculas diferentes da protease do HIV, de modo em que a melhor moléculas possa ser encontrada através de simulações computadorizadas, assim selecionadas e testadas efetivamente nos laboratórios de eficácia contra o vírus HIV. Juntando forças, o conjunto, The Scripps Research Institute, World Community Grid e a sua crescente força de voluntários podemos encontrar melhores tratamentos, muito mais rápidos e eficazes do que nunca.
Esse texto foi traduzido por Tiago Guerra e seu original pode ser encontrado no site do “World Community Grid” através desse link.
O que é a AIDS?
UNAIDS, Programa Conjunto das Nações Unidas sobre HIV / AIDS, estimou que em 2004 existiam mais de 40 milhões de pessoas em todo o mundo vivendo com o HIV, o Vírus da Imunodeficiência Humana. O vírus tem afetado as vidas de homens, mulheres e crianças em todo o mundo. Atualmente, não existe cura no horizonte, só o tratamento com uma variedade de drogas.
O Laboratório do Prof Arthur J. Olson do The Scripps Research Institute (TSRI) está estudando maneiras computacionais para a concepção de novos medicamentos anti-HIV baseado na estrutura molecular. Tem sido demonstrada repetida vezes que a função de uma molécula (uma substância composta por muitos átomos) está relacionado com a sua forma tridimensional. Olson é alvo da protease do HIV ( "pró-tee-ás"), a chave do mecanismo molecular do vírus para bloquear a maturidade do vírus. Estes bloqueadores, conhecido como "inibidores da protease", são, assim, uma forma de evitar o aparecimento dos sintomas da AIDS e prolongar vida. O Laboratório Olson está usando métodos computacionais para identificar novos medicamentos candidatos compatíveis com as características químicas necessárias para bloquear a protease do HIV. Esta abordagem geral é chamada de "Design da Base estrutural da droga", e de acordo com o National Institutes of Health's National Institute of General Medical Sciences, já teve um efeito dramático sobre a vida das pessoas vivendo com a AIDS.
Ainda mais desafiadora, o HIV é um "vírus mutante", então ele está em constante evolução, com novas variantes, algumas das quais são resistentes até mesmo aos atuais medicamentos. Por isso, é vital que os cientistas continuam a sua busca de novos e melhores medicamentos para combater este alvo móvel.
Os cientistas são capazes de determinar as formas experimentais de uma proteína e de uma droga em separadamente, mas nem sempre para ambas. Se cientistas soubessem como uma droga molécula interagisse dentro de sua proteína-alvo, os químicos poderão conceber ainda uma melhor droga, mais potente, do que os medicamentos atuais.
Para enfrentar estes desafios, o projeto FightAIDS@Home do World Community Grid's utiliza um software chamado AutoDock, desenvolvido no laboratório do Prof Olson. AutoDock é uma suíte de ferramentas que prediz como pequenas moléculas, tais como as drogas candidatas, poderão vincular ou "atracar" em um receptor conhecido da estrutura em 3D. A primeira versão do AutoDock foi escrito no Laboratório Olson, em 1990, pelo Dr. David S. Goodsell, desde então, as versões mais recentes, desenvolvida pelo Dr. Garrett M. Morris, foram liberadas, com o acréscimo de novos conhecimentos científicos e as estratégias para AutoDock, computacionalmente tornando mais robusto, mais rápidos e mais fácil de utilizar por outros cientistas. Desde o início deste projeto, o World Community Grid tem sido executando uma versão pré-lançamento do AutoDock4. Em agosto de 2007, World Community Grid começou a executar a nova versão disponível do AutoDock que tornou mais rápido e preciso, podendo manipular as flexíveis moléculas alvo e, portanto, também podendo ser utilizado para a análise de junções protéicas. O AutoDock é usado no projeto FightAIDS@Home para combinar um grande número de pequenas moléculas diferentes da protease do HIV, de modo em que a melhor moléculas possa ser encontrada através de simulações computadorizadas, assim selecionadas e testadas efetivamente nos laboratórios de eficácia contra o vírus HIV. Juntando forças, o conjunto, The Scripps Research Institute, World Community Grid e a sua crescente força de voluntários podemos encontrar melhores tratamentos, muito mais rápidos e eficazes do que nunca.
Esse texto foi traduzido por Tiago Guerra e seu original pode ser encontrado no site do “World Community Grid” através desse link.
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